Dr. Minggao Liang a récemment obtenu un doctorat dans le laboratoire de Michael Wilson à l’hopital Sick Children et à l’Université de Toronto où sa recherche visait à élucider les conséquences cis-régulatrices de la variation génétique dans le contexte de l'évolution et des maladies humaines. En savoir plus sur Minggao ci-dessous.
Sur quoi travaillez-vous ?
Le contrôle précis du moment et de l'endroit où les gènes sont exprimés est obtenu en partie par le repliement du génome en domaines associés topologiques (TAD) et sous-TAD. Les TAD délimitent les domaines d'ADN en interaction physique dans lesquels les amplificateurs peuvent contacter les promoteurs de gènes au sein du même TAD, mais sont limités dans l'accès aux promoteurs de gènes au-delà des limites du TAD. Les mutations qui perturbent l'organisation de TAD peuvent entraîner un dérèglement de l'expression des gènes par le biais d'un mécanisme de « détournement d'amplificateurs ». Telles mutations sont de plus en plus reconnues dans l'étiologie des troubles génétiques humains et des cancers.
Le trouble plaquettaire du Québec (QPD) est un trouble de coagulation autosomique dominant qui provoque un gain de fonction dans la fibrinolyse. La caractéristique principale du QPD est une surexpression > 100 fois de l'enzyme profibrinolytique, PLAU, dans les plaquettes et les mégacaryocytes. La mutation en cause est une duplication en tandem de 78 kb de PLAU, mais la façon dont cette duplication provoque une surexpression de PLAU spécifique aux mégacaryocytes est inconnue. Pour étudier le mécanisme qui cause le QPD, nous avons utilisé des approches de profilage épigénomique, de génomique comparative et de capture de conformation de la chromatine pour étudier la régulation de PLAU dans des mégacaryocytes en culture de participants atteints de QPD et de témoins non affectés. La duplication en tandem dans QPD s'étend sur une limite subTAD et a conduit à des interactions ectopiques entre PLAU et un activateur de mégacaryocyte conservé trouvé dans le subTAD voisin. Nos résultats soutiennent un mécanisme pathologique unique par lequel la réorganisation de l'architecture de subTAD entraîne un phénotype dramatique de trouble sanguin spécifique au type de cellule.
D'où venez-vous? Qu'est-ce qui vous manque dans votre ville/pays natal !
Je suis né en Chine mais j'ai grandi à Niagara et dans la banlieue de Toronto. Je ne me souviens pas beaucoup de ma ville natale, mais ce qui me manque le plus, c'est l'abondance de savoureuse cuisine de rue en fin de soirée.
Dans quelle ville habitez-vous actuellement et qu'est-ce que vous aimez le plus dans cette ville ?
Je vis actuellement à Toronto. J'adore la diversité qu'offre Toronto, surtout quand il s'agit de nourriture !
De quelles manières est-ce que vous vous détachez du travail/de la science/du milieu universitaire ?
Pendant mon temps libre, je joue et diffuse en direct un jeu stratégique appelé GO. J'avais l'habitude de jouer en compétition avant les études supérieures et je l'ai repris pendant le confinement de la pandémie. Je suppose que cela compte aussi comme un talent spécial non-chercheur.
Avez-vous une recommandation pour un livre, une émission, un film ou un documentaire ?
Allez voir "AlphaGo - Le film". C'est une introduction fantastique à GO et comment l’intelligence artificielle a transformé notre approche du jeu. De nombreux paradigmes reflètent ce que e Machine Learning effectue maintenant pour la biologie. De plus, il est gratuit à regarder sur YouTube.
Qu'est-ce qui vous a poussé à devenir chercheur ?
Un mélange d'effets environnementaux et d'héritages intergénérationnels. Mes deux parents sont dans la science et j'ai eu beaucoup d'exposition en grandissant. Il y a aussi la sensation merveilleuse qui accompagne la découverte de nouvelles choses et la compréhension de leur fonctionnement.
Si vous n'étiez pas chercheur, qu'aimeriez-vous être/penseriez-vous être ?
Je ne suis pas sûr mais probablement un cuisinier. Trouver des façons de préparer les aliments partage de nombreuses sensations fortes en tant que chercheur et, en bonus, est (généralement) comestible !
Qu'est-ce qui a suscité votre intérêt pour l'épigénétique ?
J'étais fasciné par la question de savoir comment un seul génome peut donner naissance à des centaines de types de cellules transcriptionnellement uniques dans le corps. L'épigénétique est une grande partie de ce puzzle.
Si vous pouviez donner un seul conseil à votre « première année de doctorat », quel serait-il ?
Maintenir un bon équilibre entre la vie professionnelle et la vie privée. Le temps et l'énergie dépensés à l'extérieur du laboratoire sont tout aussi essentiels à la productivité dans le laboratoire.
Où voudriez-vous voir votre recherche/domaine d'intérêt aboutir à l'avenir ?
L'un des défis principaux à l'heure actuelle consiste à interpréter les effets de la variation génétique sur l'épigénome de cellules spécifiques. Quelque chose que j'aimerais voir se produire, c'est d’être capable de prédire ces effets par ordinateur, soit-disant modifier l'épigénome in silico, comme un grand pas vers la résolution de ce défi.
