Le Consortium canadien de recherche en épigénétique, environnement et santé (CEEHRC) est membre du Consortium international de l'épigénome humain (IHEC), qui vise à produire et à diffuser des cartes de référence complètes de l'épigénome humain qui sont pertinentes pour la santé et la maladie.
Les épigénomes de référence comprennent des cartes de profils de méthylation de l'ADN du génome entier et des modifications des histones ainsi que des données sur les transcriptomes. Des données de séquençage du génome entier et de petits ARN ainsi que d'autres types de données sont également disponibles pour certains échantillons.
Le réseau du CEEHRC comprend deux centres de cartographie de l'épigénome, à Vancouver et à Montréal. Les données produites par ces centres - et d'autres projets des membres de l'IHEC - sont accessibles par les liens ci-dessous.
- Déclaration de réutilisation des données
-
Afin d'équilibrer les intérêts de toutes les parties prenantes, il est demandé aux utilisateurs des ressources de respecter la capacité des générateurs de données à publier une première analyse de leurs propres données dans un délai convenable afin de ne pas ralentir les progrès de la science. Aux fins de cette politique de publication des données, le terme "délai convenable" réfère à une période initiale de neuf mois après la publication des données dans les bases de données publiques, qui peut avoir lieu quelque temps après que les données ont été téléchargées sur ce site. Les dates de fin de soumission et d'embargo pour toutes les données soumises sont disponibles sur la liste de soumission des données.
- Téléchargement de données
-
Les données de séquences sous-jacentes, à la fois alignées (format bam) et brutes (format fastq), sont disponibles via l'étude Epigénomes de référence générée dans le cadre du Consortium international d'épigénomique humaine (IHEC) dans les Archives européennes du génome et du phénome. L'accès aux données peut être obtenu en envoyant un courriel à TDOadmin@phsa.ca ou info@epigenomes.ca. Veuillez inclure le nom de l'étude tel que référencé ci-dessus. Pour consulter et clarifier certaines des conditions à remplir avant d'autoriser l'accès aux données, veuillez consulter la copie de l'accord de distribution des données ainsi que les instructions annotées fournies.
Pour obtenir l'accès aux données, veuillez vous référer à la table EpiRR afin d'obtenir l'identifiant de l'épigénome de référence pour les échantillons d'intérêt et l'identifiant secondaire associé (ensemble de données EGA) à inclure dans votre demande.
- Citant les données du CEEHRC
-
Les utilisateurs des ensembles de données doivent reconnaître la source des données en incluant un langage similaire à celui qui suit, soit dans la section des mentions, soit dans le texte du manuscrit : "Les résultats publiés ici sont en tout ou en partie basés sur des données générées par le Consortium canadien de recherche en épigénétique, épigénomique, environnement et santé (CEEHRC), initiative financée par les Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC), Génome BC et Génome Québec. Des informations sur le CEEHRC et les chercheurs et institutions participants sont disponibles à l'adresse suivante : https://cihr-irsc.gc.ca/f/43734.html "
Veuillez envoyer un lien vers tous les articles publiés qui citent ces données à info@epigenomes.ca.
