Hossein Davarinejad est un étudiant gradué dans le laboratoire du Dr Jean-François Couture à l'Université d'Ottawa. Apprenez-en plus sur Hossein et sa recherche dans cette Q&R, et consultez sa présentation au séminaire du CCREES d'avril 2021!
Sur quoi travaillez-vous ?
J'ai rejoint le laboratoire Couture en 2018 avec l'intérêt d'utiliser la cristallographie aux rayons X pour résoudre les structures des enzymes liées à la signalisation épigénétique. De nombreuses raisons ont motivé mon orientation vers ATXR6. Premièrement, mon laboratoire a été le premier à démontrer, structurellement et biochimiquement, que ATXR6 mono-méthyle la lysine 27 sur H3.1 (Bergamin E., et al 2015 ; Science). Deuxièmement, dans un article publié dans Nucleic Acid Research par la suite, le laboratoire a démontré que le domaine PHD de l'enzyme non seulement se lie au nucléosome mais contribue à la liaison des cofacteurs. Les études sur les plantes dans lesquelles on a muté les domaines SET et PHD, ainsi que le motif PIP non caractérisé, ont révélé un impact sur l'architecture nucléaire de la chromatine. Cependant, peu était connu sur la raison pour laquelle un motif PIP mutant produirait ce phénotype. Après avoir repris ce projet, j'ai montré que le motif PIP conservé au cours de l'évolution est nécessaire pour lier le PCNA et j'ai résolu la structure cristalline du domaine PIP de ATXR6 avec la pince coulissante à ADN. Fait intéressant, nous avons découvert que le PCNA, que l'on considérait comme un transporteur local de ces enzymes possédant un domaine PIP, prédomine la liaison au substrat canonique de l'ATXR6, le nucléosome, et diminue en conséquence les niveaux de H3.1K27me1 produits par l'ATXR6. Mes travaux suggèrent que dans le contexte du rétablissement de la marque H3K27me1 post-réplication ou couplé à la réplication, ATXR6 doit être désengagé du PCNA.
D'où venez-vous? Qu'est-ce qui vous manque le plus de votre ville natale ou de votre pays ?
Je suis né et j'ai grandi en Iran, mais pour moi, Vancouver est mon chez-moi. La parfaite harmonie entre une grande ville et une nature spectaculaire me manque beaucoup, avec toutes sortes d'activités de plein air à quelques minutes de là.
Dans quelle ville vivez-vous actuellement et qu'est-ce qui vous plaît le plus de celle-ci ?
Je vis dans la région d'Ottawa-Gatineau. Aucune des deux villes n'offre une stimulation particulière pour moi en ce qui concerne la vie urbaine, mais elles ont beaucoup plus de nature à offrir que Toronto (où j'ai vécu pendant 10 ans avant d'arriver ici) et c'est certainement ce qui est le plus agréable dans ma nouvelle ville.
Comment faites-vous pour vous déconnecter du travail, de la science et du monde académique ?
J'essaie d'utiliser mon gril à charbon aussi souvent que possible pour organiser un bon barbecue. J'essaie de passer du temps avec mon chat et d'investir dans les cryptomonnaies. J'aime aussi jardiner, construire et réparer des choses.
Avez-vous des talents particuliers en dehors de la recherche que peu de gens dans votre entourage académique connaissent ?
En dehors des sciences naturelles, je vis dans le monde de l'informatique et j'essaie de maintenir mes connaissances et mes compétences à jour afin qu'elles puissent être utiles après l'obtention de mon diplôme en biochimie.
Auriez-vous une recommandation pour un livre, une émission, un film ou un documentaire ?
Un livre: 12 Rules for Life - An Antidote to Chaos, de Jordan B Peterson.
Série TV: Narcos sur Netflix
Film: Heat (1995)
Pourquoi avez-vous décidé de devenir chercheur ?
Le cours de biochimie et de biologie cellulaire que j'ai suivi en deuxième année de baccalauréat m'a vraiment interpellé. J'étais fasciné de voir à quel point la science biologique a permis d'explorer et de comprendre le fonctionnement de la vie au niveau moléculaire et d'établir des liens avec les maladies.
Si vous n'étiez pas chercheur, que voudriez-vous faire ?
Si je pouvais vivre quelques centaines d'années, je poursuivrais des études de niveau doctoral en architecture et en design d'intérieur, en physique et en astronomie, en musique, en linguistique, en ingénierie et en menuiserie.
Qu'est-ce qui a suscité votre intérêt pour l'épigénétique ?
J'ai commencé par un stage de baccalauréat en recherche dans un laboratoire spécialisé en biologie de l'ubiquitine. Une fois que j'ai appris davantage sur mon projet et étudié la littérature, j'ai constaté qu'il y avait encore beaucoup à découvrir dans ce domaine, surtout au niveau du nucléosome.
Si vous pouviez donner un conseil à vous-même en première année de doctorat, que serait-il ?
Je me dirais « Tu as choisi un laboratoire fantastique, détends-toi et profite du voyage ».
Où aimeriez-vous que vos recherches vous mènent à l'avenir ?
Dans un secteur pharmaceutique ou des sciences de la santé ayant un besoin particulier en matière d'informatique et de programmation.
Présentation au séminaire du CCREES